协同集聚能够带来地理邻近性、社会关系邻近性、技术邻近性等诸多明显优势，进而产生降低交易成本、知识溢出等效应，从而有利于创新效率的优化。但由于各地区的客观发展情况不同，两业协同集聚在驱动创新效率时，在很大概率上会受到地区客观条件的影响。从既有研究来看，学者们在研究某一因素对区域创新效率影响时，亦会考察地区客观条件的约束性规律。

例如，韩先锋等在研究“互联网＋”对区域创新效率的影响时，采用地区经济发展、贸易开放度等作为门槛条件，考察其约束规律。叶堂林等在研究科技推广服务业对区域创新效率影响时，采用经济发展阶段和创新能力作为门槛条件，考察其异质性影响。张莉娜和倪志良在研究科技人才集聚对区域创新效率的影响时，采用财政分权与民生性公共服务作为门槛条件，考察其门槛效应。

根据循环累积因果理论，一个地区的创新资源基础对于创新效率的提升有着不可忽视的作用，也会影响协同集聚在创新效率方面的效用。而在创新资源基础中，科教资源基础占据着重要地位，是地区创新发展的重要载体基础。根据区域创新系统理论，一个地区中不仅有企业创新子系统，还存在高校、科研机构创新子系统，子系统在运行过程中，“各司其职”又相互联系，影响着区域整体创新效果。

具体来说，企业子系统的功能主要在于技术成果的商业化，高校子系统的功能主要在于创造和传播知识技术、培养创新人才，研究机构子系统的功能与高校子系统类似。企业子系统与高校子系统、研究机构子系统交流互动的动力源于知识技术、资源等方面的合作。高校与科研机构拥有扎实的基础知识，高质量的人才资源，因此在新知识创造上具有明显的优势。而区域内的企业，可以借助地理的邻近性，通过正式或非正式的方式，从高校和科研机构中直接获取新的知识技术，并利用企业在市场中的优势，将新的知识技术进行转化，完善创新产业链条。

另外，已经进行商业化的知识和技术可以再次反馈给高校和科研机构，有益于促进知识技术的集成发展。在创新活动的多次循环中，地区的企业在市场上越来越具备竞争力，在创新成果的转化方面也会更具备优势，吸收高校子系统、研究机构子系统知识技术的能力也会更强，而高校和科研机构的创新能力也会得到提升，从而多渠道提升了地区创新效率。概言之，生产性服务业和制造业协同集聚虽然可以提升自身创新效率，但在区域中仍需要和高校、科研机构进行互动，进而作用于区域创新效率。因此，一个地区的科教水平极有可能对协同集聚的创新效应产生影响，科教水平越高，协同集聚对区域创新效率的正向促进作用越强烈。

此外，创新氛围也是协同集聚发挥创新效应的重要条件。简单来说，在创新氛围越好的地区，越容易吸引人才集聚，也能够愈发促进人才的之间的交流与思维碰撞，促进人才之间的合作。创新活动的基础是人才，人才之间的交流越充分、越快速，越能为地区累积人力资本并促进人力资本的高级化。在创新氛围越好的地区，越容易形成“大众创业、万众创新”的良好局面，使更多创新创业者参与进创新活动中来，这些创新创业者未必是传统意义上的创新主体，但却能在创新活动中有所贡献并享受创新收益。

协同集聚为地区带来了创新人才，这些创新人才会在创新氛围好的地区展开更频繁、更深入的知识技术交流，并与高校、科研系统中的从业人员进行高质量的互联互动，提升创新产出的概率和速率，从而对区域创新效率产生促进作用。此外，在创新氛围越好的地区，企业间、人才间竞争也越激烈，这会使企业和人才处于不断自我更新、自我学习、自我完善的良性状态之中，从而对区域创新效率产生正向影响。概言之，一个地区的创新氛围极有可能对协同集聚的创新效应产生影响，创新氛围越浓厚，协同集聚对创新效率的正向促进作用会越强烈。

由于生产性服务业本身脱胎于制造业，因此与制造业有着强产业关联。两个产业之间是相互依赖、协同发展、价值共造的关系。在产业关联的作用下，两个产业会倾向于在地理上协同集聚，以获得集聚的外部性优势。具体而言，两业协同集聚可以带来地理邻近性、社会关系邻近性、技术邻近性、小企业集聚、高度专业化这5点明显优势。在这些优势下，协同集聚能够产生多种有益于创新活动的效应，从而促进了创新效率的提升。

首先，协同集聚能够促进两个产业的创新互动，有利于创新要素耦合，弱化了创新过程中的风险性，增强了创新成功率，也强化了创新激励。其次，协同集聚能够带来降低交易成本的效应，企业运行成本降低，使企业负担研发经费支出成为了可能。同时，创新是企业经营中一项风险性较高的活动，交易成本的降低不仅可以直接减少企业进行创新所需投入的成本，还可以同时减少企业创新的风险性。

再次，协同集聚能够促进知识溢出，地理上的邻近性促进了人才与人才之间“面对面”交流的便捷程度；技术邻近性和专业化特征，提升了“面对面”交流过程中知识传递的效率和质量；社会关系上的邻近性可以促进“面对面”交流的频率与深度。在知识溢出的效应下，企业可以以较低的成本甚至是无成本获取专业的知识技术。这些知识技术往往具备着不可编码的特性，是基于个人经验的产物，有着较为强烈的个人属性和根植性特点。此外，协同集聚所带来的知识溢出还能够惠及区域中的其余创新主体，从而有利于本地区创新效率的优化，并有可能通过空间关联、创新要素的流动影响邻近地区的创新效率。最后，协同集聚能够促进知识技术的累积与自我强化，促进知识技术在创新主体间的传递，有利于提升创新效率。

制造业和生产性服务业的空间依赖程度有所加强。各制造业行业和生产性服务业的协同集聚程度有所差异，协同集聚指数较高的制造业行业是文教、工美、体育和娱乐用品制造业，计算机、通信和其他电子设备制造业，家具制造业，电气机械和器材制造业等；较低的是烟草制品业，有色金属冶炼和压延加工业，石油、煤炭及其他燃料加工业等。